其中遗传因素胚胎染色体异常是促成自然流产最常见的病因，约占50%。事实上，如果没有进行流产物的染色体检查，临床上大多数患者根本无法明确流产的病因。所以，流产组织的染色体检查对于明确本次流产病因非常重要。夫妻双方染色体正常，胎儿染色体还会有问题吗。夫妇生育后代时，会分别将自己一半的染色体平均分配给自己的后代。这个分配的过程是伴随着精子或者卵子的成熟过程的，生物学上称之为“减数分裂”。虽然这个过程非常的奇妙和精细，话分两头也还是会经常出错的，一旦出错就可能促成某个精子或者卵子多分到一条或者少分到一条染色体，这样就会致使其形成的胚胎多一条或者少一条染色体，造成自然流产或者严重的染色体病的孩子出生。
这类父母染色体正常而胎儿染色体异常者，我们称之为“染色体新发畸变”。自然流产组织染色体异常，还能生育吗。自然流产组织染色体异常有很多类型，其中最常见的就是前面我们所说的这种新发畸变。即夫妻双方染色体是正常的，但鉴于精子或卵子形成过程中，染色体“偶然的分配不均”所促成的。这种情况我们弱弱的表示，不用太担心，大多数患者再次可以自然怀孕到健康分娩。却，这种分配错误的风险随着女方的年龄增加而逐渐增加。研究显示当女方年龄>40岁，自然流产物染色体异常的比例高达80%以上。
也就是说随着年龄增加，这种归因于胎儿染色体异常引发的自然流产风险也是在显著增加的。这也是女性随着年龄增加，生育力降低到逐步丧失的过程的表现形式之一。